ITS序列(Internal transcripsed Spacer sequence)是指真核生物(包括真菌、植物和一些原生生物)中核糖体RNA (rRNA)基因保守区域之间的DNA序列。ITS区域位于小亚基(18S) rRNA基因和大亚基(28S) rRNA基因之间。
ITS区域由ITS1和ITS2两个子区域组成。ITS1位于18S rRNA基因和5.8S rRNA基因之间，ITS2位于5.8S rRNA基因和28S rRNA基因之间。ITS区域的长度和序列组成在不同物种之间存在差异，使其成为物种鉴定和系统发育分析的有用标记。
ITS序列已成为分子生物学和生态学领域广泛使用的分子标记，特别是用于真菌多样性和分类研究。它通常用于DNA条形码，这涉及到测序和比较未知生物的ITS区域与参考数据库，以识别和分类它们。ITS区域提供了足够的序列变异性来区分近亲物种，并已被证明是物种鉴定和系统发育研究的有价值的工具。
ITS区域的测序通常包括使用特定引物对该区域进行PCR扩增，然后进行DNA测序。然后可以将获得的ITS序列与数据库中的已知序列进行比较，以确定所研究生物的身份和亲缘关系。
总的来说，ITS序列是物种鉴定、系统发育分析以及真核生物(特别是真菌)多样性和进化研究的有力工具。
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